太阳能光伏发电的缺点:

能量密度低。尽管太阳投向地球的能量总和极其巨大，但由于地球表面积也很大，而且地球表面大部分被海洋覆盖，真正能够到达陆地表面的太阳能只有到达地球范围辐射能量的10%，太阳能的利用实际上是低密度能量的收集、利用。

占地面积大。太阳能能量密度低，这就使得光伏发电系统的占地面积会很大，每10KW光伏发电功率占地约100㎡，平均每平方米面积发电功率为1000W。但是现在越来越多的光伏发电系统可以利用建筑物、构筑物的屋顶和立面，以逐步改善光伏发电系统占地面积大的不足。

转换效率低。光伏发电的最基本单元是太阳能电池组件。光伏发电的转换效率指的是光能转换为电能的比率。目前晶体硅光伏电池的转换效率最高为17%左右，非晶硅光伏电池最高不超过10%。

间歇性工作。在地球表面，光伏发电系统只能在白天发电，晚上则不能发电，这和人们的用电方式和习惯不符。除非在太空中没有昼夜之分的情况下，太阳能电池才可以连续发电。

受自然条件和气候环境因素影响大。太阳能光伏发电的能源直接来源于太阳光的照射，而地球表面上的太阳光照射受自然条件和气候的影响很大，一年四季、昼夜交替、地理纬度和海拔高度等自然条件以及阴晴，雨雪、雾天甚至云层的变化都会严重影响系统的发电状态。

地域依赖性强。不同的地理位置和气候，使各地区的日照资源相差大。光伏发电系统只有在太阳能资源丰富的地区应用效果才好。

系统成本高，由于太阳能光伏发电的效率低，到目前为止，光伏发电的成本仍然是其他常规发电方式(如火力和水力发电)的几倍，这是制约其广泛应用的最主要因素。

晶体硅电池的制造过程高污染、高能耗。晶体硅电池的主要原料是纯净的硅，硅是地球上含量仅次于氧的元素，主要存在形式是沙子(二氧化硅)。从沙子一步步变成含量为99.9999%以上纯净的晶体硅，期间要经过多道化学和物理工序的处理，不仅要消耗大量能源，还会造成一定的环境污染。